就業協議與勞動合同是用人單位錄用畢業生時所制定的書面協議，可能在很多應屆畢業生來看，就業協議與勞動合同大似相同，必須提醒：就業協議與勞動合同之間分處兩個相互聯系的不同階段，主要表現在：
差異一：就業協議是畢業生和用人單位關于將來就業意向的初步約定，對于雙方的基本條件以及即將簽訂勞動合同的部分基本內容大體認可，并經用人單位的上級主管部門，高校畢業生和用人單位簽字蓋章承諾履行協議，高校不作為第三方。高校只在“有關信息及意見”一欄填寫(或制作長條章加蓋)學校的聯系電話、郵箱、郵寄地址及相關意見等信息。一經畢業生、用人單位、高校、用人單位主管部門簽字蓋章，即具有一定的法律效應，是編制畢業生的就業計劃和將來可能發生違約情況時的判斷依據。
差異二：畢業生就業協議的內容主要是畢業生如實介紹自身情況，并表示愿意到用人單位就業、用人單位表示愿意接收畢業生，學校同意推薦畢業生并列入就業計劃進行派遣。勞動合同的內容涉及勞動報酬、勞動保護、工作內容、勞動紀律等方方面面，更為具體.勞動權利義務更為明確。
差異三：畢業生就業協議是畢業生在校時，由學校參與見證的，與用人單位協商簽訂的，是編制畢業生就業計劃方案和畢業生派遣的依據，勞動合同是畢業生與用人單位明確勞動關系中權利義務關系的協議，學校不是勞動合同的主體，也不是勞動合同的見證方，勞動合同是上崗畢業生從事何種崗位、享受何種待遇等權利和義務的依據。
差異四：一般來說就業協議簽訂在前，勞動合同訂立在后，如果畢業生與用人單位就工資待遇、住房等有事先約定，亦可在就業協議備注條款中予以注明，日后訂立勞動合同對此內容應予認可。
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