安徽醫(yī)科大學(xué)為安徽省省屬重點大學(xué)，前身是1926年5月創(chuàng)辦于上海的私立東南醫(yī)科大學(xué)。1930年更名為東南醫(yī)學(xué)院。1949年底響應(yīng)華東局“面向農(nóng)村，走向內(nèi)地”的號召，內(nèi)遷安徽懷遠(yuǎn)，成為安徽省第一所高等醫(yī)科院校。1952年遷址合肥，改名為安徽醫(yī)學(xué)院。1986年經(jīng)安徽省人民政府批準(zhǔn)，更名為安徽醫(yī)科大學(xué)，1996年得到原國家教委同意。2015年獲批成為教育部、國家衛(wèi)生計生委與安徽省人民政府共建高校。學(xué)校位于安徽省會合肥市，校園環(huán)境優(yōu)美，交通便利。

學(xué)校將現(xiàn)代著名教育家蔡元培先生為學(xué)校前身東南醫(yī)學(xué)院師生的題詞“好學(xué)力行，造就良醫(yī)”確立為校訓(xùn)，弘揚(yáng)“愛國愛民，獻(xiàn)身人類健康”的光榮傳統(tǒng)，秉承“興國、奉獻(xiàn)、仁愛”的育人理念，倡導(dǎo)踐行“求真、求精、求新”的校風(fēng)學(xué)風(fēng)，致力于建設(shè)高水醫(yī)科大學(xué)。
學(xué)校現(xiàn)有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、口腔醫(yī)學(xué)院（安徽省口腔醫(yī)院）、衛(wèi)生管理學(xué)院、生命科學(xué)學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、藥學(xué)院、馬克思主義學(xué)院、國際教育學(xué)院、公共基礎(chǔ)學(xué)院、研究生學(xué)院、成人教育學(xué)院（繼續(xù)教育學(xué)院）、臨床醫(yī)學(xué)院、第一臨床醫(yī)學(xué)院（第一附屬醫(yī)院）、第二臨床醫(yī)學(xué)院（第二附屬醫(yī)院）、巢湖臨床醫(yī)學(xué)院（附屬巢湖醫(yī)院）、第四臨床醫(yī)學(xué)院（第四附屬醫(yī)院）、醫(yī)學(xué)檢驗系、醫(yī)學(xué)影像系、麻醉學(xué)系、醫(yī)學(xué)心理學(xué)系、醫(yī)學(xué)美容系等直屬教學(xué)機(jī)構(gòu)。

學(xué)校擁有5所直屬附屬醫(yī)院（第一附屬醫(yī)院、第二附屬醫(yī)院、第四附屬醫(yī)院、附屬巢湖醫(yī)院、附屬口腔醫(yī)院??安徽省口腔醫(yī)院），6所非直屬附屬醫(yī)院（附屬省立醫(yī)院、第三附屬醫(yī)院??合肥市第一人民醫(yī)院、附屬合肥醫(yī)院??合肥市第二人民醫(yī)院、附屬安慶醫(yī)院??安慶市立醫(yī)院、附屬六安醫(yī)院??六安市人民醫(yī)院、附屬宿州醫(yī)院??宿州市立醫(yī)院），與合肥市共建附屬阜陽醫(yī)院。學(xué)校堅持開放、合作、共贏的方針，與軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院、清華大學(xué)、中科院合肥物質(zhì)研究院、香港大學(xué)等建立戰(zhàn)略合作伙伴關(guān)系，并在解放軍北京軍區(qū)總醫(yī)院、空軍總醫(yī)院、海軍總醫(yī)院、武警總醫(yī)院、解放軍306醫(yī)院、解放軍307醫(yī)院、新疆自治區(qū)人民醫(yī)院等建立臨床學(xué)院，目前臨床學(xué)院達(dá)60余所，各專業(yè)實踐教學(xué)基地120余所，分布于安徽省各地市及北京、上海、江蘇、山東、浙江、廣東、福建、新疆等省市區(qū)。
學(xué)校設(shè)有臨床醫(yī)學(xué)（“5+3”一體化）、臨床醫(yī)學(xué)（五年制）、口腔醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、生物技術(shù)、護(hù)理學(xué)、公共事業(yè)管理、藥學(xué)、中藥學(xué)、醫(yī)事法學(xué)、食品質(zhì)量與安全、臨床藥學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程等28個本科專業(yè)。擁有臨床醫(yī)學(xué)、藥學(xué)2個博士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點，26個博士學(xué)位授權(quán)學(xué)科點，擁有臨床醫(yī)學(xué)博士專業(yè)學(xué)位授予權(quán)，有10個碩士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點，74個碩士學(xué)位授權(quán)學(xué)科點。建立了藥學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)3個博士后科研流動站。皮膚病與性病學(xué)為國家重點學(xué)科，中藥藥理學(xué)、中醫(yī)腫瘤病學(xué)為國家中醫(yī)藥重點學(xué)科，有12個國家臨床重點專科，19個省級重點學(xué)科，42個省級臨床醫(yī)學(xué)重點學(xué)科和重點扶持學(xué)科；建有1個科技部省部共建國家重點實驗室培育基地，2個教育部重點實驗室、25個省部級（重點）實驗室（工程技術(shù)研究中心、科技公共服務(wù)臺、國際科技合作基地、人文社科研究基地），是國家藥品臨床研究基地。有1個教育部科技創(chuàng)新團(tuán)隊，2個安徽省科技創(chuàng)新團(tuán)隊，2個安徽省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊，3個安徽省高校科研創(chuàng)新臺團(tuán)隊，1個安徽省高校智庫。躋身國家“中西部高校基礎(chǔ)能力提升工程”，是國家級大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃承擔(dān)高校。有4個國家級高等學(xué)校專業(yè)建設(shè)點，2個國家級專業(yè)綜合改革試點，3個國家級卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃項目；1個國家級教學(xué)團(tuán)隊；2個國家級精品課程和精品資源共享課程；2個國家級實驗教學(xué)示范中心,1個國家級虛擬仿真實驗教學(xué)中心；1名國家“*”教學(xué)名師。1門課程入選教育部來華留學(xué)英語授課品牌課程。獲得國家級教學(xué)成果二等獎一項。

在職教職工1400余人（含直屬附屬醫(yī)院教學(xué)職稱人員），專任教師隊伍中具有博士、碩士學(xué)位的教師占89.5%。現(xiàn)有國家“百千萬人才工程”，“新世紀(jì)優(yōu)秀人才”，教育部骨干教師，衛(wèi)生部、人事部突出貢獻(xiàn)中青年專家，全國首批青年拔尖人才，“*”，“皖江學(xué)者”特聘教授，高校領(lǐng)軍人才等30人次，安徽省高校引進(jìn)領(lǐng)軍人才團(tuán)隊4個。省部級創(chuàng)新團(tuán)隊6個。有24人次在國際學(xué)術(shù)組織和SCI源期刊任職，5人次擔(dān)任國家“十一五”、“十二五”規(guī)劃教材主編。3人擔(dān)任國家級專科學(xué)會主委，1人在亞洲學(xué)術(shù)組織擔(dān)任*，9人入選教育部高校醫(yī)藥學(xué)科指導(dǎo)委員會專家。10多人獲得全國、全省模范教師、優(yōu)秀教師光榮稱號。
全日制在校生共14000余人，其中研究生3700余人，留學(xué)生360余人。2011年以來，學(xué)校共承擔(dān)“973”計劃、國家科技支撐計劃、國家科技惠民計劃和國家自然科學(xué)基金項目等470余項。國家自然科學(xué)基金立項數(shù)年來保持安徽省屬高校領(lǐng)先地位。研究成果分別入選2010、度中國科學(xué)十大進(jìn)展和2012年度中國高校十大科技進(jìn)展。獲國家科技進(jìn)步二等獎一項、教育部高等學(xué)校科學(xué)研究優(yōu)秀成果獎（科學(xué)技術(shù)）自然科學(xué)類一等獎一項、中國青年科技獎二項、中華醫(yī)學(xué)科技獎一等獎三項、中華醫(yī)學(xué)科技獎醫(yī)學(xué)科普獎和衛(wèi)生管理獎各1項。持續(xù)有重大原創(chuàng)性基礎(chǔ)研究成果產(chǎn)出，先后在《細(xì)胞》、《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》、《自然遺傳》等國際著名SCI刊物發(fā)表多篇高水研究論文。
學(xué)校成立84個省、校級研究所。編輯出版的國家級及面向全國發(fā)行的期刊有《安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報》、《中國藥理學(xué)通報》、《臨床與實驗病理學(xué)雜志》、《中華疾病控制雜志》等14種。
學(xué)校藏書120萬余冊。學(xué)校圖書館是全國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)資源共享網(wǎng)絡(luò)安徽省級中心館，為安徽省高校數(shù)字圖書館醫(yī)學(xué)分中心、教育部科技查新工作站。
學(xué)校同德國、澳大利亞、瑞典、美國、加拿大、日本、韓國以及臺灣、香港地區(qū)的高等院校廣泛開展合作交流，雙方互派專家學(xué)者、互派學(xué)生、相互交流信息資料、共同開展人才培養(yǎng)和科研合作。